南极磷虾（Euphausia superba）以其作为南极海洋食物链的基础而闻名，它是海豹，企鹅和鲸鱼等海洋掠食者的食物。而它对海洋碳汇的重要性还鲜为人知。海洋碳汇也就是，浮游植物在光合作用过程中将二氧化碳从大气中去除，并通过一系列过程固存到海底。伦敦帝国学院发表在《自然通讯》杂志上的一项新研究强调了磷虾对碳循环的影响，并敦促考虑商业磷虾捕捞对海洋化学和全球气候的影响。南极磷虾通过摄食浮游植物并排泄出最后沉入到海底的含有碳和营养丰富的粪便颗粒，是碳循环的组成部分，是使海洋变得肥沃的铁和其他养分的主要贡献者。南大洋浅水和深水中的下沉碳颗粒主要由磷虾粪便颗粒组成。南大洋是全球最大的碳汇之一，因此磷虾对大气中的碳水平以及全球气候都有重要影响。而到目前为止，关于捕捞南极磷虾可能对大气碳和海洋化学的影响，以及鲸鱼种群的增长可能对磷虾数量产生的影响尚无共识。