苏格兰国民信托组织的自然保护高级顾问指出，苏格兰一个中等规模鲑鱼养殖场（年最大养殖产量2500吨）排放的废水量与大小是奥本市两倍的一个城镇所排放的量相同。苏格兰西海岸所有城镇加起来排放的污水量也就相当于一个中等规模鲑鱼养殖场排放的污水量。与此同时，一部分专家也发出了警告，苏格兰鲑鱼养殖正对环境产生着致命的影响。养殖场将大量废水排放到海中，而其中的有机物含量约占80%。该高级顾问还指出，在苏格兰几乎没有针对养殖场所使用的致命化学品的规定，某些养殖场过氧化氢的用量越来越多。同时，养殖场的死鱼数量在过去的4-5年间也在不可逆转地增加。而烂鳃病以及新的海虱机械性除去疗法被列为鲑鱼死亡的主要原因。野生鱼类中的神秘疾病导致了河流中充满了死鱼。养鱼场和水产养殖虽然并不是这一现象的罪魁祸首，但肯定对已受到威胁的物种资源造成了额外的压力。在苏格兰，已有河流可直接归类为大西洋鲑鱼已灭种的河流。

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